Гений Джеральд Работник возглавлял команду, изучавшую инопланетное существо по прозвищу Шедоу. С последним сдружилась внучка Мария, предложившая организовать побег. В процессе девушка умирает, а остальных помещают в анабиозные капсулы на десятилетия. События переносятся в современный городок Грин-Хиллз, где неплохо освоился сверхскоростной ежик Соник. Его друг и шериф Томом Ваковски организует веселую вечеринку. Неожиданно появляется мистер Рокуэлл, представитель секретной государственной организации ГОН. Он поручает главному герою отправиться в Токио и предотвратить катастрофу. Некое существо вырвалось из заточения и сеет хаос в округе. Как выясняется, речь шла про того самого Шедоу.