Человечество практически полностью исчерпало запасы полезных ископаемых на суше, которая превратилась в выжженную пустыню и стала непригодной для жизни за исключением нескольких оазисов и отдаленных островов. Большая часть цивилизации переместилась с земли на морское дно, где основала колонии, пригодные для жизни, но вскоре и там на смену не долгому миру приходит борьба за природные ресурсы и жизненное пространство. Начинается открытое противостояние между Организацией Объединенных Океанов Земли и несколькими неприсоединившимися государствами. Для борьбы с враждебными странами и в целях поддержания правопорядка группой ученых разрабатывается экспериментальная субмарина. Когда судно сходит со стапелей, руководство назначает его командиром автора проекта капитана Натана Бриджера. Опытный офицер принимает командование «Sea Quest», на которой должен не только обеспечивать безопасность, но и исследовать неизученные участки океанских глубин.