Сорвав операцию террористов из Синдиката в Минске, Итан Хант возвращается в Соединенные Штаты. Ему должны были оставить сообщение в магазине музыкальных пластинок. Однако, противники устроили внутри ловушку и усыпили агента газом. Перед тем как потерять сознание, главный герой видит как женщина, действовавшая в рядах противника, расправляется с подельниками. Благодаря ей Итану удается выжить, но неприятности не заканчиваются. Начальство ЦРУ недовольно деятельностью команды ОМН и принимает решение перевести участников на другую работу. Более того, к словам Ханта о таинственном Синдикате относятся как к теории заговора. Единственный выход, в одиночку проводить расследование. В определенный момент главный герой вновь встречает Ильзу Фауст, которой обязан жизнью. Ее уволили из МИ-6, но борьбу с международной преступностью бойкая дама не забросила.